Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNF330Q9Y3S2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF330Q9Y3S2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms