Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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SH3BP1Q9Y3L3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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SH3BP1Q9Y3L3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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SH3BP1Q9Y3L3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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SH3BP1Q9Y3L3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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SH3BP1Q9Y3L3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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SH3BP1Q9Y3L3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SH3BP1Q9Y3L3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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SH3BP1Q9Y3L3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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SH3BP1Q9Y3L3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SH3BP1Q9Y3L3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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