Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SETD1BQ9UPS6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms