Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM35Q9UPQ4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM35Q9UPQ4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms