Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF18Q9UNG2 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms