Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDHA12Q9UN75 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms