Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
INO80Q9ULG1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms