Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms