Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
MLH3Q9UHC1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MLH3Q9UHC1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms