Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
COPS7AQ9UBW8 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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