Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC6Q9UBN7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms