Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRPC4Q9UBN4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRPC4Q9UBN4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms