Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CPNE7Q9UBL6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPNE7Q9UBL6 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms