Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X0

DPM3, Dolichol-phosphate mannosyltransferase subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPM3Q9P2X0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DPM3Q9P2X0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DPM3Q9P2X0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DPM3Q9P2X0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DPM3Q9P2X0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms