Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ARHGAP28Q9P2N2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ARHGAP28Q9P2N2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ARHGAP28Q9P2N2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ARHGAP28Q9P2N2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ARHGAP28Q9P2N2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ARHGAP28Q9P2N2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ARHGAP28Q9P2N2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ARHGAP28Q9P2N2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ARHGAP28Q9P2N2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ARHGAP28Q9P2N2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ARHGAP28Q9P2N2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms