Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGSF9Q9P2J2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IGSF9Q9P2J2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IGSF9Q9P2J2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IGSF9Q9P2J2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IGSF9Q9P2J2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IGSF9Q9P2J2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IGSF9Q9P2J2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IGSF9Q9P2J2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms