Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC38.93■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC38.92■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC38.92■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC38.91■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC38.9■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC38.89■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC38.89■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC38.89■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.89■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.82
CCDC180Q9P1Z9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC38.88■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC38.88■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC38.87■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC38.87■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC38.87■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.85■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC38.85■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
CCDC180Q9P1Z9 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms