Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP1Q9NZI2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms