Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GDE1Q9NZC3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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