Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR3EQ9NVU0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR3EQ9NVU0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms