Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATAD3AQ9NVI7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms