Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RRP7BPQ9NSQ0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms