Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC8Q9H0W5 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms