Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL4Q9C0H6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL4Q9C0H6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms