Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F0

ASXL3, Putative Polycomb group protein ASXL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASXL3Q9C0F0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ASXL3Q9C0F0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ASXL3Q9C0F0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms