Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UPF3BQ9BZI7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UPF3BQ9BZI7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms