Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
NIFKQ9BYG3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NIFKQ9BYG3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms