Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CARD11Q9BXL7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CARD11Q9BXL7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms