Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SYCP2Q9BX26 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYCP2Q9BX26 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms