Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HIRIP3Q9BW71 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HIRIP3Q9BW71 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms