Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3CQ9BUI4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR3CQ9BUI4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms