Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU40

CHRDL1, Chordin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDL1Q9BU40 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRDL1Q9BU40 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms