Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SHANK2-AS3Q9BTD1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SHANK2-AS3Q9BTD1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SHANK2-AS3Q9BTD1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SHANK2-AS3Q9BTD1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SHANK2-AS3Q9BTD1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SHANK2-AS3Q9BTD1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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