Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GINS3Q9BRX5 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms