Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ZNF559Q9BR84 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZNF559Q9BR84 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms