Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MMP19Q99542 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MMP19Q99542 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MMP19Q99542 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MMP19Q99542 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MMP19Q99542 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MMP19Q99542 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MMP19Q99542 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MMP19Q99542 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MMP19Q99542 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MMP19Q99542 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MMP19Q99542 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MMP19Q99542 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MMP19Q99542 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MMP19Q99542 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MMP19Q99542 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MMP19Q99542 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MMP19Q99542 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MMP19Q99542 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MMP19Q99542 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MMP19Q99542 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MMP19Q99542 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MMP19Q99542 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MMP19Q99542 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MMP19Q99542 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MMP19Q99542 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MMP19Q99542 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MMP19Q99542 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MMP19Q99542 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MMP19Q99542 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MMP19Q99542 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MMP19Q99542 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MMP19Q99542 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MMP19Q99542 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MMP19Q99542 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MMP19Q99542 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MMP19Q99542 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MMP19Q99542 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MMP19Q99542 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MMP19Q99542 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MMP19Q99542 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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