Protein–RNA interactions for Protein: Q99442

SEC62, Translocation protein SEC62, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC62Q99442 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC62Q99442 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SEC62Q99442 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SEC62Q99442 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC62Q99442 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC62Q99442 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC62Q99442 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC62Q99442 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC62Q99442 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC62Q99442 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC62Q99442 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC62Q99442 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC62Q99442 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC62Q99442 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC62Q99442 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC62Q99442 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC62Q99442 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC62Q99442 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC62Q99442 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC62Q99442 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC62Q99442 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC62Q99442 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC62Q99442 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC62Q99442 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC62Q99442 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC62Q99442 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC62Q99442 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC62Q99442 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC62Q99442 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC62Q99442 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC62Q99442 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC62Q99442 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC62Q99442 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC62Q99442 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC62Q99442 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC62Q99442 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms