Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

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Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCNX1Q96RV3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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