Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFRSF13CQ96RJ3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms