Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMTK3Q96Q04 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms