Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CMTM3Q96MX0 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms