Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM20AQ96MK3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
FAM20AQ96MK3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FAM20AQ96MK3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
FAM20AQ96MK3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FAM20AQ96MK3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms