Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
USP47Q96K76 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
USP47Q96K76 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms