Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VCPIP1Q96JH7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.9 ms