Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LRIG1Q96JA1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LRIG1Q96JA1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms