Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms