Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MALSU1Q96EH3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms