Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SYTL4Q96C24 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYTL4Q96C24 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYTL4Q96C24 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms