Protein–RNA interactions for Protein: Q96B54

ZNF428, Zinc finger protein 428, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428Q96B54 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF428Q96B54 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF428Q96B54 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms