Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC102AQ96A19 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC102AQ96A19 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC102AQ96A19 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC102AQ96A19 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC102AQ96A19 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC102AQ96A19 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC102AQ96A19 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC102AQ96A19 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC102AQ96A19 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC102AQ96A19 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC102AQ96A19 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC102AQ96A19 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC102AQ96A19 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC102AQ96A19 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC102AQ96A19 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC102AQ96A19 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC102AQ96A19 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC102AQ96A19 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC102AQ96A19 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC102AQ96A19 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC102AQ96A19 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC102AQ96A19 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC102AQ96A19 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC102AQ96A19 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC102AQ96A19 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC102AQ96A19 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC102AQ96A19 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC102AQ96A19 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC102AQ96A19 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC102AQ96A19 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC102AQ96A19 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC102AQ96A19 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC102AQ96A19 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC102AQ96A19 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC102AQ96A19 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC102AQ96A19 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC102AQ96A19 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC102AQ96A19 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC102AQ96A19 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC102AQ96A19 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC102AQ96A19 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms